南科大借鉴世界一流理工科大学的学科设置和办学模式，以理、工、医为主，兼具商科和特色人文社科的学科体系，在本科、硕士、博士层次办学，在一系列新的学科方向上开展研究，使学校成为引领社会发展的思想库和新知识、新技术的源泉。

南方科技大学（简称：南科大）是深圳在中国高等教育改革发展的时代背景下创建的一所高起点、高定位的公办新型研究型大学。

2022 年 2 月 14 日，教育部等三部委公布第二轮“双一流”建设高校及建设学科名单，南方科技大学及数学学科入选“双一流”建设高校及建设学科名单。

截至目前，南方科技大学已签约引进教师 1363 人，包括院士 59 人（签约引进与自主培养全职院士 43 人），国际会士 58 人， 教育部特聘教授（含青年）39 人，“国家特支计划”专家 17 人、“国家自然科学基金杰出青年基金”获得者 49 人、“国家自然科学基金优秀青年基金”获得者 29 人。

教学科研系列教师 90% 以上具有海外工作经验，60% 以上具有在世界排名前 100 名大学工作或学习的经历，师资队伍中高层次人才占比约 65%。

学校以“学分制、书院制、导师制”和“国际化、个性化、精英化”为核心和特色，大力培养拔尖创新人才。学校采用书院制管理，目前共设立致仁、树仁、致诚、树德、致新、树礼 6 个书院。

南方科技大学通过以学分制、导师制、书院制（“三制”）为基础，人才培养的个性化、精英化、国际化（“三化”）为特色，依托“631”招生体系、课程体系、科研体系、创新实训体系、“2+2”通识 - 专业融合式培养体系、国际化三学期体系（“六体系”）构建南方科技大学国际化创新型本科人才培养模式。

学校设置 8 个二级学院，下设 33 个系（院）、中心，此外，设有 2 个独立教学单位；开设 37 个本科专业。